La proporción sobre ingresos exentos y gravados, ¿es sobre el total de ingresos facturados o cobrados?

Buen día.

En la empresa se manejan ingresos gravados a la tasa del 16% y exentos, tengo entendido que tengo que realizar el cálculo para sacar el factor de prorrateo de IVA para determinar el monto de IVA Acreditable, pero es sobre ingresos cobrados (exentos y gravados) y gastos pagados.

Es decir ¿tengo que determinar cuántos ingresos gravados y exentos nos pagaron así como que gastos pague y sacar el factor en base al flujo? ¿o es sobre el total de ingresos facturados?